Martin Wagner ist ab August 2014 als Schulleiter am Johann-Gottfried-Herder-Gymnasium in Berlin-Lichtenberg tätig. Zudem ist er Vorsitzender des Interessensverbands Berliner Schulleitungen (IBS) und führt regelmäßige Seminare für Schulleitungen zu den Themen "Kollegiale Auswertung von Unterricht und "Schulinspektion" sowie "Schulentwicklung und Qualitätsmanagement" durch. Martin Wagner veröffentlicht regelmäßig in der Zeitschrift "b:sl Beruf: Schulleitung" zu bildungspolitischen Themen.